南昌大学附属口腔医院实行南昌大学口腔医学院、南昌大学附属口腔医院、江西省口腔医院、江西省口腔病研究所四位一体的管理体制，是集医疗、教学、科研、预防、保健、培训为一体的三级甲等口腔专科医院。前身系创建于1980年的江西医学院口腔医学系，2003年增名“江西省口腔医院”，2005年由江西医学院附属口腔医院更名为南昌大学附属口腔医院。
医院设有牙体牙髓科、牙周病科、口腔粘膜病科、口腔颌面外科、口腔修复一科、修复二科、口腔正畸一科、正畸二科、口腔预防科、儿童口腔科、口腔种植科、特需门诊、综合急诊科、颞下颌关节科、分门诊、麻醉科、手术室、病理科、放射科、检验科、心电理疗室、消毒供应室、技工室等23个临床与辅助科室和16个行政职能科室。
