亳州市妇幼保健院源于2012年10月成立的亳州市妇幼保健所，2016年1月更名为亳州市妇幼保健计划生育服务中心，2019年7月加挂亳州市妇幼保健院牌子，是一所集医疗、预防、保健、康复、教学、科研为一体的妇幼保健院。
医院位于亳州市高新技术开发区香蒲路与老君大道交叉口，占地20000平方米，总建筑面积30131平方米，设置床位300张。根据国家妇幼健康机构业务科室设置指南精神，医院设“四大部”（孕产保健部、儿童保健部、妇女保健部、计划生育技术服务部），设产科、妇科、儿科、新生儿科、家庭化产房、情景训练中心、水疗中心、儿童心理、儿童营养、身高促进、视训中心、口腔保健、盆底筛查与治疗、孕期心理、孕期营养、乳腺筛查与治疗、中医催乳、熏蒸、婚检、遗传咨询、计划生育新筛、产筛、听筛等业务科室100多个。配有钨靶机、双板DR、腹腔镜、四维彩超等医疗设备600余台（件）。
