复旦大学附属儿科医院安徽医院（安徽省儿童医院、安徽医科大学儿童医学中心、安徽省儿童健康与疾病临床医学研究中心、安徽省儿童医学研究所）是国家发展改革委、国家卫生健康委批准的第一批国家区域医疗中心试点单位，由省人民政府和复旦大学附属儿科医院，依托安徽省儿童医院合作共建，为政府举办的公益性医疗机构。是国务院医改领导小组秘书处确定的建立健全现代医院管理制度试点单位。现有望江路院区、深圳路院区和三里庵院区三个院区。隶属安徽省卫生健康委，是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体三级甲等儿童专科医院。是安徽医科大学研究生培养基地，皖南医学院研究生培养单位。
设置42个临床医技科室（其中34个临床科室、8个医技科室），7个多学科平台中心。现有国家级新生儿保健特色专科、拥有7个省级临床重点（培育）专科：儿童骨科、新生儿科、儿童心胸外科、儿童康复医学科、儿童肾内科、重症医学科（PICU）、儿童神经内科。
