湖北省疾病预防控制中心主要履行政府交付的全省疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、健康教育与健康促进、实验室检测分析与评价、技术管理与应用研究指导等公共卫生服务职能;同时承担预防医学与公共卫生领域的应用性科学研究。是全省病原微生物检测中心、毒物检测中心、全省疫苗贮藏与配送中心,省反恐办确定的负责生物恐怖袭击应对的技术支持中心,省卫生厅指定的全省医改基本公共卫生服务均等化、爱国卫生、疾控系统强基与规范化建设和人才培训技术指导中心。
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