中国民间中医医药研究开发协会(以下简称“协会”)由卫生部原部长崔月犁、公安部原常务副部长李广祥、卫生部原中医局局长吕炳奎等几位老领导发起,由卫生部上报国务院,经国家体制改革委员会批准,1985年6月20日在北京成立,成立大会在人民大会堂举行,时任中央书记处书记的习仲勋同志等中央领导出席了成立大会,习仲勋同志在人民大会堂当场为协会题词:“中医中药来之民间,用科学方法加以研究提高。再用之民间,为人类造福“。
1991年经国家中医药管理局批准,国家民政部核准注册为全国性,行业性,非营利性的法人社会团体。协会的登记管理机关是民政部,党建领导机关是中央和国家机关工委,业务指导单位是国家中医药管理局。